他サーバーのIISアプリケーションプール・リサイクル

using (ServerManager server = ServerManager.OpenRemote(サーバー名)) {

  ApplicationCollection pools = server.ApplicationPools;

  foreach (ApplicationPool pool in pools) {

    if (pool.Name == 対象のプール名)

      pool.Recycle();

  }

}

動作しているプログラムのアカウントで他サーバーを動かすはずなので、
同じアカウントで他サーバーへログインできる必要があるはずです。
注意点でした。